这个话题很宽泛，如果说包含桌面计算机的话，*nix根本没有一点点胜算，还是限定一下吧，单指服务器应用。
*nix指Linux、Unix以及Unix的变种，比如FreeBSD、OpenBSD、NetBSD等等，也可以把Solaris带进来，没所谓的……
首先我们要假定一个前提，就是在硬件不出故障的情况下，这个虽然废话，但是很多文章作对比都忽视了这个因素。
首先，我在IDC行业创业是从2001年开始的，自建3线机房也都是2009年的事情了，管理、维护各种DIY或者品牌服务器至少几千台了，用户规模从一个小网站到某个金融交易所全都有，我从90年代开始玩Linux的，2004年开始玩Unix系统，包括几个BSD和Solaris等，所以我这里的数据还是有说服力的。从安全、稳定、性能以及易用几个方面来分析一下吧。
安全，这个是很多玩Linux的人喜欢诟病Windows的理由之一，只要提起Windows就要摆出一副不屑的表情，然后说Windows不安全，说网络安全是多么重要。这里要先纠正一个概念，网络安全是信息安全的一个子集，信息安全包含一二十个领域，网络安全是一个很小的范畴，而且网络安全一般指底层通信层面，跟操作系统没一毛钱关系的。ok，让我们来逐个击破。说Windows漏洞多是吧，请自己去看看漏洞公布列表，Windows的漏洞数量从未排到前列，反而一直是这种伪高手认为安全的Linux名列前茅，呵呵，事实胜于雄辩吧？
这里我也说一下自己对漏洞的看法。有漏洞很正常，因为软件在编写的时候只能适用于当下环境，又因为软件是运行在操作系统之上的，所以当软件运行的周边环境发生变化，或者遇到其他软件的干涉，那么这个软件的运行就可能会产生异常，这种异常有可能会构成漏洞。但是这个事情的重点是环境变化了，而软件自身先天缺陷是比较少的。比如说，因为Windows足够易用，所以在服务器上面装很多软件和小工具的人不在少数，而这个现象就很容易导致系统异常，举个例子，windows上面最出名的编辑器UltraEdit 32，同样是基于安全的理由，相信合格的windows管理员都会在服务器上安装这个软件，这样对文件进行编辑的时候不会产生不可预知的风险，但是呢，Linux上面就没有这么好用的编辑器，vi或者nano这样的和记事本是一个档次的，类似的软件很多，那么装的软件多了，稳定性和安全性以及性能自然会下降，这个层面来讲，任何操作系统都是一样的。
然后说说windows常见的安全防范思路吧。因为windows是一个商业软件，微软理想中的架构是主域控制器、副控制器、加上若干活动目录、树林什么什么的，再加上若干接点，还有统一共享存储什么的，这是一个很庞大的体系，虽然我们用不上，但是系统为了实现这个架构，在底层打开了很多系统服务什么的，比如rpc、winrm这类的，我们用不上的话那就用防火墙封掉这类端口，安全控制的思路就是最小权限优先，比如你只是挂机的话，哪怕浑身是漏洞，只要防火墙不开，谁也拿你没办法的，漏洞本身要想被使用，也是有运行环境的，黑客根本碰不到你，那就不能拿你怎么样。这方面反而显得*nix比较弱，因为windows本身是设计为集群运行的，*nix设计的是单机运行。
然后说说稳定吧。windows因为易用，所以很多人忍不住要折腾，比如我。我自己的做法是生产环境剥离出去，不装任何跟生产无关的软件，然后折腾的机器单独抽出来两台，随便折腾，不好用了直接还原一下就好。这样情况下根本没什么稳定性问题，可能出乎很多人预料的是，那个金融交易所的用户服务器端全都是windows，只有一个可能是交易终端的机器是linux的，他的6个机柜，100多台服务器运行一年没出过问题的，连死机都没有过，当然小吹嘘一下，我是给他们的管理员上过课的，什么可以做什么不可以做都是跟他们讲好的。所以你说windows稳定么？
接着说性能。最常见的应用就是跑个网站吧，两种系统同样可以用的就是php和mysql了，不同的web服务器是iis和apache，我曾经详细做过一次测试，选了常见的五六种linux和两个bsd系统进行对比，php和mysql版本完全一致，这样的环境下，windows性能比linux和bsd高出50%之多，可能又要让很多人郁闷了，呵呵。而且纯静态页面的话，iis的性能比apache高出很多倍，基本没法估计，iis单机硬抗20000并发请求是没压力的，apache能上200就不错，反复优化配置也达不到1000的，不断的崩溃，根本没有可比性。更让人掉眼镜的是，linux比bsd效率高不少，呵呵。这个事情其实很好想，iis本身是内核态的，apache是用户态，本身这就有个很大的差距，所以单纯跑网站的人来讲，apache+linux确实没什么优势可讲。
最后是易用性了，这个不打算说了，因为实在没必要，有正常思维的人都懂的。
来个结论吧。这篇文章的内容是有失偏颇的，因为我的用户群大部分都是跑网站的，少部分是oa、crm或者金融交易这样的，所以针对这部分用户群来讲，windows是很适合的操作系统，而linux的整体成本其实很高，记住一句话：免费的是最贵的。如果说你运行一个软件或者数据库或者跑网站的话，那么这两种操作系统都可以运行几年不重启不死机什么的，这也是我这里的数据之一，没什么区别的。
最后呢，IT人的特性之一就是喜欢贬低他人来提高自己，那我也照做一次吧。很多人想当然的认为用了linux就安全就稳定就高效，这本身是个笑话，也是个谎话，地球上没有这么好的事（OpenBSD例外），人云亦云对提高自己没有一毛钱帮助的，自己做过对比测试，才知道什么是真的。